浮游生物数据共享平台EcoTaxa(中文版)正式上线

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浮游生物数据共享平台EcoTaxa(中文版)正式上线

2024-06-03 08:26:17| 来源: 网络整理| 查看: 265

中文版EcoTaxa功能与原EcoTaxa完全一致,但是数据库完全独立,专门为中国用户建立,现已包含了四万多张浮游动物图片,涉及多个中国海区浮游动物数据,全国的海洋生物研究人员都可以在该平台浏览或上传感兴趣海区的浮游生物图像,进行分类、鉴定、计数乃至绘制粒径谱等工作。

EcoTaxa网站通常配合ZooSCAN、UVP、FlowCam等设备一起使用。使用设备拍摄得到浮游生物图片后,软件Zooprocess会以标准化的程序处理原始图片,对原始图片进行自动的提取并测量图片中不同个体的形态学参数,通过对形态学参数的提取与分析,进一步获得样品的粒径组成、生物学体积等相关信息;此后,将图片和相关信息上传到EcoTaxa网站,可以选择网站上已有的或自己新创建的数据库快速对图片中的浮游生物种类进行自动鉴定、分类、统计,得到该批浮游生物具体的分类统计数据。这样大大地提高了物种分类的效率,能够帮助用户们节省宝贵的科研时间。此外,数字化的图片及分类保存形式,方便使用者日后对项目进行检索、调用。

同时,Ecotaxa网站的颗粒物模块可以根据UVP获取的颗粒物数据及指定的筛选条件绘制出特定粒径范围的粒径谱,能更加直观地展示出不同水深下某种粒径范围的颗粒物浓度的变化趋势。

中文版EcoTaxa网站项目分类界面

完整的系统树分类

颗粒物粒径谱图

信息来源:WATERTOOLS

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