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“大数据”这个词同样也可以用来描述这几年不断积累的化学数据,唯一不同的就是化学领域内的数据量的“庞大”及其快速增长的速度,还有数据集的复杂性。因此需要有专门的工具对这些数据进行收集和分析。而数据的收集和分析对于数据的处理的提高越来越有价值。 为了让大家从更专业的角度搜集并使用数据,这里搜集并整理了一些非常有用的数据资源(库)。 注:下文紫色资源��表示需要付费,橘色资源��表示免费获取。 BIOSIS Previews�� 这里不仅有Biological Abstracts的杂志内容,还包括一些未被期刊收录的报告、综述和会议等信息。 来源:汤森·路透(Thomas Reuters) BIOSIS Previews�� 这里不仅有Biological Abstracts的杂志内容,还包括一些未被期刊收录的报告、综述和会议等信息。 来源:汤森·路透(Thomas Reuters) Cambridge Structural Database (CSD)�� 这是一个专门汇总小分子有机物和金属有机晶体结构的资源库,包括了五十万个X光线和中子衍射分析结果。 来源:英国剑桥晶体学数据中心(The Cambridge Crystallographic Data Centre) Cambridge Structural Database (CSD)�� 这是一个专门汇总小分子有机物和金属有机晶体结构的资源库,包括了五十万个X光线和中子衍射分析结果。 来源:英国剑桥晶体学数据中心(The Cambridge Crystallographic Data Centre) ChEMBL�� 这里有大量的生物活性数据、功能数据以及ADMET(药物的吸收,分配,代谢,排泄和毒性)生物活性数据资源。 来源:英国欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatic Institute) ChEMBL�� 这里有大量的生物活性数据、功能数据以及ADMET(药物的吸收,分配,代谢,排泄和毒性)生物活性数据资源。 来源:英国欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatic Institute) Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI)�� 专注于小分子化合物。 来源:英国欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatic Institute)隶属Open Biomedical Ontologies Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI)�� 专注于小分子化合物。 来源:英国欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatic Institute)隶属Open Biomedical Ontologies Chemicalize.org�� 提供基于网页端的化学结构鉴定功能及其他文本,部分功能免费。 来源:匈牙利ChemAxon Chemicalize.org�� 提供基于网页端的化学结构鉴定功能及其他文本,部分功能免费。 来源:匈牙利ChemAxon ChemInform RxnFinder�� 属于ChemInform Reaction Library(CIRX)的一种搜索引擎服务,包括了从1990年到现在100多种期刊中的两百多万种反应数据。是合成有机化学家的工具。 来源:Wiley ChemInform RxnFinder�� 属于ChemInform Reaction Library(CIRX)的一种搜索引擎服务,包括了从1990年到现在100多种期刊中的两百多万种反应数据。是合成有机化学家的工具。 来源:Wiley TOXNET�� 包含的数据类型有化合物与药物、疾病与环境、环境健康、职业安全卫生、毒害、风险评估与法规以及毒理学。 来源:美国毒理学与环境健康信息计划(Toxicology and Environmental Health Information Program) TOXNET�� 包含的数据类型有化合物与药物、疾病与环境、环境健康、职业安全卫生、毒害、风险评估与法规以及毒理学。 来源:美国毒理学与环境健康信息计划(Toxicology and Environmental Health Information Program) ChemPlanner�� 通过预测合成策略和一系列广泛的相关合成方法以及可用构建帮助化学家为目标分子设计不同的合成路线。 来源:Wiley ChemPlanner�� 通过预测合成策略和一系列广泛的相关合成方法以及可用构建帮助化学家为目标分子设计不同的合成路线。 来源:Wiley ChemSpider�� 专业的化学结构数据库,有超过四千三百万种的结构、属性以及相关信息数据。 来源:英国皇家化学协会(Royal Society of Chemistry—RSC) ChemSpider�� 专业的化学结构数据库,有超过四千三百万种的结构、属性以及相关信息数据。 来源:英国皇家化学协会(Royal Society of Chemistry—RSC) ChemSub Online�� 是由个人组织建立的数据库,主要包括化学物质信息。 来源:Robert Charles Knight和Aniruddha Warakoutikha ChemSub Online�� 是由个人组织建立的数据库,主要包括化学物质信息。 来源:Robert Charles Knight和Aniruddha Warakoutikha ChemSynthesis�� 合成参照物和物理性质的化学品数据。 来源:ChemSynthesis 小组 ChemSynthesis�� 合成参照物和物理性质的化学品数据。 来源:ChemSynthesis 小组 Computer Aided Material Preselection by Uniform Standards (CAMPUS)�� 来自参与材料生产商的树脂数据库,这里的数据库仅包括了严格执行统一标准的可比较的材料信息。 来源:德国Chemie Wirtschaftsförderungs股份有限公司 Computer Aided Material Preselection by Uniform Standards (CAMPUS)�� 来自参与材料生产商的树脂数据库,这里的数据库仅包括了严格执行统一标准的可比较的材料信息。 来源:德国Chemie Wirtschaftsförderungs股份有限公司 Crystal Works�� Chemical Database Service提供了大量的晶体结构数据。 来源:英国科技设施委员会(Science and Technology Facilities Council) Crystal Works�� Chemical Database Service提供了大量的晶体结构数据。 来源:英国科技设施委员会(Science and Technology Facilities Council) Derwent World Patent Index (DWPISM)�� 主要为专利信息数据。 来源:汤森·路透(Thomson Reuters) Derwent World Patent Index (DWPISM)�� 主要为专利信息数据。 来源:汤森·路透(Thomson Reuters) DETHERM�� 纯物质和混合物的热物理数据。 来源:德国DECHEMA e.V DETHERM�� 纯物质和混合物的热物理数据。 来源:德国DECHEMA e.V Dmoz – NMR spectra Database�� 核磁共振谱数据。 来源:全球志愿编辑社区(global community of volunteer editors) Dmoz – NMR spectra Database�� 核磁共振谱数据。 来源:全球志愿编辑社区(global community of volunteer editors) Drug Bank�� 将详细药物数据与综合全面药物标靶信息结合的生物信息学与化学信息学数据库。 来源:加拿大国立卫生研究所(Canadian Institutes of Health Research)丨阿尔伯塔创新-健康解决方案(Alberta Innovates – Health Solutions)丨代谢组学创新中心(TMIC) Drug Bank�� 将详细药物数据与综合全面药物标靶信息结合的生物信息学与化学信息学数据库。 来源:加拿大国立卫生研究所(Canadian Institutes of Health Research)丨阿尔伯塔创新-健康解决方案(Alberta Innovates – Health Solutions)丨代谢组学创新中心(TMIC) eMolecules�� 化学物质信息提供者。 来源:eMolecules, Inc. eMolecules�� 化学物质信息提供者。 来源:eMolecules, Inc. Electronic Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis (eROS)�� 为所有从事有机合成工作的化学家提供的试剂和催化剂信息。 来源:Wiley Electronic Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis (eROS)�� 为所有从事有机合成工作的化学家提供的试剂和催化剂信息。 来源:Wiley Eurochem�� 化学与相关行业的综合指导目录及搜索引擎。 来源:瑞士欧罗化工集团股份公司(EuroChem Group AG) Eurochem�� 化学与相关行业的综合指导目录及搜索引擎。 来源:瑞士欧罗化工集团股份公司(EuroChem Group AG) Google Scholar�� 学术文献资料的基础搜索引擎。 来源:谷歌 Google Scholar�� 学术文献资料的基础搜索引擎。 来源:谷歌 hmdb – The Human Metabolome Database�� 人类内发现的小分子代谢物数据的详细信息。 来源:加拿大代谢组学创新中心(The Metabolic Innovation Centre) hmdb – The Human Metabolome Database�� 人类内发现的小分子代谢物数据的详细信息。 来源:加拿大代谢组学创新中心(The Metabolic Innovation Centre) Inorganic Crystal Structure Database (ICSD)�� 完整地无机晶体结构鉴定,包含了177,000同行评审过的数据条目。 来源:德国FIZ卡尔斯鲁厄股份有限公司-莱布尼兹的信息基础设施研究院(FIZ Karlsruhe – Leibniz-Institut für Information sinfrastruktur) Inorganic Crystal Structure Database (ICSD)�� 完整地无机晶体结构鉴定,包含了177,000同行评审过的数据条目。 来源:德国FIZ卡尔斯鲁厄股份有限公司-莱布尼兹的信息基础设施研究院(FIZ Karlsruhe – Leibniz-Institut für Information sinfrastruktur) International Patent Documentation Center Database (INPADOC)�� 国际专利汇总,包含同族专利和法律状态信息,每周更新。 来源:欧洲专利局(European Patent Office—EPO) International Patent Documentation Center Database (INPADOC)�� 国际专利汇总,包含同族专利和法律状态信息,每周更新。 来源:欧洲专利局(European Patent Office—EPO) IUPAC Standards Online�� 国际理论和应用化学联合会(IUPAC)标准数据库,提取自Pure and Applied Chemistry杂志。 来源:德国Walter de Gruyter股份有限公司 IUPAC Standards Online�� 国际理论和应用化学联合会(IUPAC)标准数据库,提取自Pure and Applied Chemistry杂志。 来源:德国Walter de Gruyter股份有限公司 KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes�� 分子水平层面的生物系统高级功能与效用数据库资源,尤其涵盖了基因组测序和其他高通量实验技术产生的大规模分子数据集。 来源:Kanehisa实验室 KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes�� 分子水平层面的生物系统高级功能与效用数据库资源,尤其涵盖了基因组测序和其他高通量实验技术产生的大规模分子数据集。 来源:Kanehisa实验室 Merck Index�� 化学品、药物和生物制品的大百科全书,10,000个单一物质或者相关化合物基团专著,包括有机命名反应专论附录。 来源:英国皇家化学协会(Royal Society of Chemistry—RSC) Merck Index�� 化学品、药物和生物制品的大百科全书,10,000个单一物质或者相关化合物基团专著,包括有机命名反应专论附录。 来源:英国皇家化学协会(Royal Society of Chemistry—RSC) MMsINC Search�� 商用虚拟筛选和化学信息学使用列表。 来源:意大利帕多瓦大学 MMsINC Search�� 商用虚拟筛选和化学信息学使用列表。 来源:意大利帕多瓦大学 NIST Chemistry WebBook�� 40,000多种化合物的化学和物理属性数据。 来源:美国国家标准与技术研究所(NIST) NIST Chemistry WebBook�� 40,000多种化合物的化学和物理属性数据。 来源:美国国家标准与技术研究所(NIST) NMRShiftDB�� 有机结构的核磁共振(NMR)光谱数据,可以进行频谱预测((13C、 1H及其他原子核),光谱、结构及其他属性的搜索。 资料来源:NMRShiftDB 项目 NMRShiftDB�� 有机结构的核磁共振(NMR)光谱数据,可以进行频谱预测((13C、 1H及其他原子核),光谱、结构及其他属性的搜索。 资料来源:NMRShiftDB 项目 eChemPortal�� 生态毒性、环境归趋和命运及毒性的物理化学属性。 来源:经济合作与发展组织(OECD) eChemPortal�� 生态毒性、环境归趋和命运及毒性的物理化学属性。 来源:经济合作与发展组织(OECD) OpenFoodTox�� 欧洲食品安全局(EFSA)风险评估使用的毒理学信息摘要,包括食物和喂送链中的有毒物质,每年更新一次。 来源:欧洲食品安全局(EFSA) OpenFoodTox�� 欧洲食品安全局(EFSA)风险评估使用的毒理学信息摘要,包括食物和喂送链中的有毒物质,每年更新一次。 来源:欧洲食品安全局(EFSA) OrgSyn�� 有机化合物合成的详细步骤。 来源:Organic Syntheses, Inc. OrgSyn�� 有机化合物合成的详细步骤。 来源:Organic Syntheses, Inc. PubChem�� 小分子的生物活性信息。 来源:美国国家生物技术信息中心(NBI) PubChem�� 小分子的生物活性信息。 来源:美国国家生物技术信息中心(NBI) PubMed 来自MEDLINE、生命科学期刊和在线图书的两千四百多万个生物医学文献引文,引文包含了PubMed Central和发行网站的全文内容链接。 来源:美国国家生物技术信息中心(NBI)丨美国国家医学图书馆丨美国国立卫生研究院 PubMed 来自MEDLINE、生命科学期刊和在线图书的两千四百多万个生物医学文献引文,引文包含了PubMed Central和发行网站的全文内容链接。 来源:美国国家生物技术信息中心(NBI)丨美国国家医学图书馆丨美国国立卫生研究院 Reaxys�� Beilstein和Gmelin数据库的引用数据,包括化学专利。 来源:Elsevier Reaxys�� Beilstein和Gmelin数据库的引用数据,包括化学专利。 来源:Elsevier Science of Synthesis�� 包括有机和有机金属化学从十九世纪至今所研发的合成方法的评论。 来源:Thieme Science of Synthesis�� 包括有机和有机金属化学从十九世纪至今所研发的合成方法的评论。 来源:Thieme SciFinder�� 化学与相关科学中的参考文献、物质和反应的综合权威资源。 来源:化学文摘社(CAS) SciFinder�� 化学与相关科学中的参考文献、物质和反应的综合权威资源。 来源:化学文摘社(CAS) Scopus�� 同行评审文献、科学期刊、书籍和会议录的摘要和引文数据库,具有跟踪、分析以及可视化研究功能。 来源:Elsevier Scopus�� 同行评审文献、科学期刊、书籍和会议录的摘要和引文数据库,具有跟踪、分析以及可视化研究功能。 来源:Elsevier Spectra Lab�� 使用经验谱数据(二百二十多万条MS、NMR和IR 光谱)的光谱数据系统,先进的软件功能可以帮助化学家、毒理学家和生命科学家鉴定化学物质。 来源:Wiley Spectra Lab�� 使用经验谱数据(二百二十多万条MS、NMR和IR 光谱)的光谱数据系统,先进的软件功能可以帮助化学家、毒理学家和生命科学家鉴定化学物质。 来源:Wiley Spectral Database for Organic Compounds (SDBS)�� 有机化合物的综合光谱数据库系统,包括34.600个化合物的六种不同类型的光谱(EI-MS、1H-NMR、13C-NMR、FT-IR、Raman、ESR)。 来源:日本国家先进工业科学技术研究所(AIST) Spectral Database for Organic Compounds (SDBS)�� 有机化合物的综合光谱数据库系统,包括34.600个化合物的六种不同类型的光谱(EI-MS、1H-NMR、13C-NMR、FT-IR、Raman、ESR)。 来源:日本国家先进工业科学技术研究所(AIST) Springer Materials�� 250, 000种材料和化学系统的3000个物理和化学属性的数值和图形数据。 来源:Springer Springer Materials�� 250, 000种材料和化学系统的3000个物理和化学属性的数值和图形数据。 来源:Springer Web of Science�� 通过引文和受控标引权威数据库为出版物与研究者之间建立关联。 来源:Clarivate Analytics Web of Science�� 通过引文和受控标引权威数据库为出版物与研究者之间建立关联。 来源:Clarivate Analytics World Wide Protein Data Bank (wwPDB)�� 蛋白质、核酸和复杂组装体的3D结构信息。 来源:全球蛋白质数据库基金会(Worldwide Protein Data Bank Foundation) World Wide Protein Data Bank (wwPDB)�� 蛋白质、核酸和复杂组装体的3D结构信息。 来源:全球蛋白质数据库基金会(Worldwide Protein Data Bank Foundation) ZINC�� 专门为虚拟筛选搜集的商用化合物,包含三千五百多万中化合物的3D格式。 来源:美国加利福尼亚大学旧金山分校Irwin和shoichet实验室 ZINC�� 专门为虚拟筛选搜集的商用化合物,包含三千五百多万中化合物的3D格式。 来源:美国加利福尼亚大学旧金山分校Irwin和shoichet实验室 延伸阅读,直接点中标题可查看: 更多精彩阅读,点标题下方化学加关注后,点底部“进入公众号”,用手机左下角小键盘输入: 回复ai150,查看《他不是海归,却是全国最牛博导和最年轻的院士!》 回复ai11,查看《17岁他说要把海洋清洗干净:没人相信:21岁他做到了!》 回复ac-44,查看《研究僧专属MV:满满全是炫(xin)酷(suan)学术日常……》 回复q21,查看《补钙为啥不用氯化钙?》 回复s23,查看《化学工作者不容易,经常是顶着“炸弹”在工作!》 回复q109,查看《清华学者在自来水中检出9种亚硝胺致癌物,要不要买个净水器应急?》 回复p19,查看《哎呦!胶黏剂你原来是个这么傲娇的人物!》 回复e05,查看《大神探福尔摩斯电影中的化学问题》 回复o10,查看《这样的化学情书,这样的英文情歌,哪个更唯美?》 回复f13,查看《化学反应还能这么演,秒懂有木有?》 声明:尊重原创、保护原创是化学加始终坚持的原则;化学加的分享转载,都已经获得对方的授权,并且会在开头位置清楚注明出处;欢迎其它媒体、公号与化学加合作,请勿擅自转载或二次转载。 化学加主编微信号:huaxuejiawang返回搜狐,查看更多 |
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