IF=11! 转录组和蛋白质组联合分析海马体不同区域应激反应机制

题目：Distinct Proteomic, Transcriptomic, and Epigenetic Stress Responses in Dorsal and Ventral Hippocampus期刊：Biological Psychiatry影响因子：11.982主要技术：转录组，蛋白质组研究背景生活中的压力会导致焦虑、创伤后应激障碍和人类认知障碍。参与急性应激反应的一个关键组织是海马体。急性压力通过改变海马体不同区域功能引发不同的应答反应。海马体的内在组织其长背腹侧轴高度保守，背侧（前部）海马（dHC）参与介导空间导航和记忆形成，而腹侧（后部）海马体（vHC）则参与情绪调节。作者为了研究海马体不同区域压力应答的分子效应，在已有的转录组研究基础之上，结合正在迅速发展蛋白质组学方法，希望揭示生物学和临床相关的生物标志物。研究内容及结果1. dHC和vHC的转录组分析作者选择C57BL/6J 雄性小鼠的海马组织不同区域：背侧区域（dHC）、腹侧区域（vHC）（n=5）进行转录组测序，有超过20％的检测基因（13902个基因中的3081个）在dHC和vHC之间存在差异表达（p ±0.3）（图1C）。随后进行Pathway富集分析，得到几个显著富集通路（图1B）。基于转录组数据，作者对前期研究人员的转录组结果进行验证，最后确定了490个具有强差异表达的基因（FC > 2，p

图1 dHC和vHC之间的转录组学和蛋白质组学分析

图2 dHC富集基因网络互作分析