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【影像组学入门百问】#11

2024-06-02 03:14| 来源: 网络整理| 查看: 265

// 理论上可以做,但不同研究上的效果未可知。因为jpg等图片格式的灰度范围(或称为"窗宽")通常不如专业医学影像格式(如nifti,dicom等)大。个人没有看过文献使用图片格式进行医学影像的相关研究,有见过的朋友可以讨论。

为什么医学影像研究不能用普通图片格式? 从DICOM说起

本文要点: 1、DICOM文件的头文件里包含重要信息,是普通图片格式没有的。 2、DICOM文件的“灰阶”范围比普通图片大得多。

因为我个人是在浙大研究所里做研究,所以从没想过标题中的问题。与临床医生们交流多,发现很多人面临这样的问题,获取医学影像数据手续繁琐,实践中获取png或jpg一类的影像更加容易。那么,像png和jpg这类图像文件适不适合做研究呢?答案是否定的。这要从DICOM医学影像文件说起。

DICOM全称Digital Imaging and Communications in Medicine,中文一般翻译为“医疗数字影像传输协定”。严格来讲,DICOM不仅是一种影像格式,还包含网络传输协议。是由多家协会制定的,对医学影像进行处理、储存、打印、传输的标准协定。它涵盖几乎所有临床医学影像,包括X射线,CT,核磁共振,超声等。目前采用的是DICOM 3.0版本协议。

DICOM文件由Header头文件以及Image影像两部分构成。注意,重点来了。DICOM的Header头文件是我们平时使用的png、jpg等图片文件所没有的。那么Header里面包含了什么呢?主要包括四类信息:Patients病人信息,Study检查信息,Series序列信息以及Image图像信息。 病人信息主要包括患者姓名、性别、ID等。 检查信息包括检查号、检查时间、检查部位等。 序列信息包括检查模态(MRI,CT,DR等),影像层厚等信息。 影像信息对医学影像相关的研究可能至关重要,因为里面包含了图像采样率、分辨率、像素物理间距等等。 从这里我们可看到,例如我们想计算ROI(感兴趣区)体积时,Header中的像素物理距离就成了必不可少的。而这是png、jpg文件无法提供的。

此外,从图像本身角度讲。Png、jpg一类的图像通常是0 ~ 255,共256灰阶表示。而DICOM显然不同。例如CT影像的中“灰度”的单位是Hounsfield,简称Hu,范围是-1024 ~ 3071(通常转换到0 ~ 4096范围)。以此衡量人体组织对X射线的吸收率。且定义水的吸收率为0 Hu。由此可见,DICOM比普通图片格式有着更加精细的“灰度分辨率”。

本文仅是对DICOM文件的科普,更加细致的内容请参考DICOM协议文件。另外美国诊断医学物理师,西安电子科技大学贾广教授的视频课程对DICOM进行了比较清晰的介绍。(B站搜:BV1JJ411W7Fv)



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