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打开软件后,通过双击窗口灰色区域或点Prism(棱镜)的小三角,新建工程文件。在弹出的向导窗口选择表格类型为Grouped,如下图。 将数据复制粘贴到Prism的表格中,接下来需要对数据矩阵做转置,点击Analyze按钮,计算方法选Transpose X and Y,如下: 转置参数的设置保持默认即可,如下: 转置效果如下,当然也可在Excel中做完转置再粘贴到Prism中,这里主要还是想为大家介绍下Prism的分析功能。接着点击Graphs选项下新生成的图表,选择相应的图表类型。 堆叠图在Grouped 的summary data选项下,如下图。 接着对图表做一些个性化的调整,比如改变颜色、调整坐标轴的粗细等,这些操作在之前的教程已反复出现过,这里不做赘述。这里重点介绍一个非常好用的功能:反转堆叠顺序。 除了反转柱状图的堆叠次序之外,还可以反转相应的图例顺序,这样就可以方便地把“Unclassified”置于最“底”层,如下图。 第二种 首先,我们需要先对转置后的数据进行处理:计算每个物种的绝对丰度占比(即相对丰度)。点Analyze 按钮,计算方法选Fraction of total,如下: 计算方式选择按行计算,计算结果以百分数的方式显示(最大值为100),设置如下: 然后打开计算结果页面,在Graph选项下新建图表,图表类型选择堆叠图,如下: 然后只需要对图表做些个性化的调整即可,比如,颜色可以选择只有两种色相的渐变色。图例的位置还可以自己调整,比如分成两列置于图表的下方等,这里不做赘述。 最终的效果如下: 最后,你也可以直接使用相对丰度绘制百分比堆叠图,这样就不需要用Prism计算百分数啦!如果你想学习Prism这个软件可以点击 阅读原文,观看刚上线的Graphpad Prism科研作图系列视频教程,好啦,今天的内容就到这里啦! 原价200元的课程,现在仅需129元!VIP会员免费看! 电脑端: 欢迎登录Omicshare课堂 (www.omicshare.com/class)观看; 可通过点击阅读原文或基迪奥生物微信公众号底部菜单栏视频教程进行观看。 |
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